自創刊以來，先后被列為“中國科技論文與引文數據庫（CSTPCD）”（1987年）、“中國科學引文數據庫（CSCD）”（1989年）、“中國學術期刊綜合評價數據庫（CAJCED）”（2002）統計源來源期刊（均為數據庫創建之年被收錄）。 自1998年中國科學技術信息研究所發布的首份《中國科技期刊引證報告》（核心版）以來，本刊均被評選為“中國科技核心期刊”。1997年的影響因子為0.324，上升至2021年的核心影響因子為1.743，在30本基礎醫學類期刊中位列第一。 2004年入選為“中國科技期刊精品數據庫”。首次榮獲2009年度“百種中國杰出學術期刊”稱號。2010年、2013年、2017年分別遴選為第二、第三、第四屆“中國精品科技期刊”（2008年為首屆，遴選排名前300的國內期刊）。2014-2017年連續4年被評選為“中國國際影響力優秀期刊”。2011年以來，均被評選為“RCCES中國權威學術期刊（A+）”。 自1992年以中國基礎醫學類核心期刊入編《中文核心期刊要目總覽》1992年版（第1版）以來，至今已連續入編至2023年版（第10版）。 2023年入選《科技期刊世界影響力指數（WJCI）報告》（2023年科技版），已連續4年。 2022年入選“預防醫學與衛生學高質量科技期刊分級目錄”（2021年版）。 1987年被美國醫學索引Medline檢索數據庫收錄（截止到2017年6月），并先后被Scopus（1987-1995,1998-2016,2021年7月2日被重新收錄）、Embase（1987-1995,1998-2016,2021年被重新收錄）、EBSCO（2014年起）、JSTChina（2007年起）、CABI（2003年起）、Zoological Record（1998年起）、WPRIM（1983年起）、Ulrichsweb (2009年起）、Google Scholar等數據庫收錄。