《云南農業大學學報(自然科學)》（雙月刊，ISSN 1004-390X）由云南省教育廳主管，云南農業大學主辦。1986年創刊時為半年刊，1989年改為季刊，2004年改為雙月刊。本刊是面向國內外公開發行的學術研究刊物，是中國科學引文數據庫（CSCD）來源期刊、中文核心期刊、中國科技核心期刊、中國農業科學核心期刊。

主要刊登生物技術和農業生物多樣性研究、作物遺傳育種研究、植物保護、土壤科學、園藝與食品科學、動物科學、農業生態與環境科學、農業工程等領域以第一手資料撰寫的學術論文、研究報告、研究簡報等。