連續(xù)多次榮獲政府和行業(yè)組織授予的榮譽：榮獲第二屆國家期刊獎百種重點期刊;連續(xù)三屆(2013，2015，2017)入選國家新聞出版廣電總局“百強報刊”;連續(xù)五屆榮獲中國精品科技期刊并于2016年入選百種中國杰出學(xué)術(shù)期刊;2012，2013，2014年榮獲中國國際影響力優(yōu)秀學(xué)術(shù)期刊獎;教育部第四、五屆中國高校精品科技期刊;連續(xù)七屆榮獲陜西省精品科技期刊;2021年入選陜西省首屆“三秦卓越科技期刊”;2021年度中國農(nóng)業(yè)期刊領(lǐng)軍期刊，2022，2024年度中國高校科技期刊建設(shè)示范案例庫百佳科技期刊;2023， 2024年度中國農(nóng)業(yè)期刊行業(yè)“優(yōu)秀團隊”及“融媒體先進單位”。

　　《西北植物學(xué)報》被北京大學(xué)《中文核心期刊要目總覽》來源期刊、中國科技核心期刊、中國科學(xué)引文數(shù)據(jù)庫(CSCD)來源期刊核心期刊、《中國學(xué)術(shù)期刊(光盤版)影響因子年報》統(tǒng)計源期刊、RCCSE中國核心學(xué)術(shù)期刊、科技期刊世界影響力指數(shù)報告(WJCI)、中國開放獲取期刊數(shù)據(jù)庫(China Open Access Journal，COAJ)、荷蘭《文摘與引文數(shù)據(jù)庫》(Scopus)、瑞典開放存取期刊目錄(DOAJ)、美國《生物學(xué)文摘預(yù)評》(BA)、美國化學(xué)文摘社(CAS)、英國《國際農(nóng)業(yè)與生物中心文摘》(CABI)、俄羅斯《文摘雜志》(AJ)、日本《科學(xué)技術(shù)振興機構(gòu)數(shù)據(jù)庫》(JST)等多種國內(nèi)外著名檢索機構(gòu)收錄，是中國植物學(xué)領(lǐng)域?qū)W術(shù)成果走向世界的重要橋梁。